Ansvaret for skolernes økonomi varetages af Økonomi- og Koncernafdelingen i ministeriet.
Ansvaret for uddannelsens indhold samt afholdelse af prøver ligger i Styrelsen for Undervisning og Kvalitet.
Ansvaret for tilsynet med undervisningen, skolernes økonomi og institutionsdriften ligger også i Styrelsen for Undervisning og Kvalitet.
Institutionerne
Inden for de rammer, der er fastlagt i ministeriets love og bekendtgørelser, er det konkrete ansvar for FVU-undervisning og FVU-prøver placeret hos Voksenuddannelsescentrene (VUC), der har ansvaret for FVU-udbuddet.
VUC kan indgå driftsoverenskomster med andre voksenuddannelsesinstitutioner og varetager tilsynet i forhold til FVU, der udbydes hos driftsoverenskomstparten. VUC'et fører et pædagogisk, retligt og økonomisk tilsyn.
Ansvaret på den enkelte institution er fordelt på to niveauer: Bestyrelsen og institutionens ledelse.