Tilsyn med frie fagskoler omfatter den faglige kvalitet, regeloverholdelse og skolens økonomi.
Styrelsen for Undervisning og Kvalitet fører tilsyn med undervisningen på efterskoler og frie fagskoler.
Styrelsen for Undervisning og Kvalitet fører tilsyn med efterskoler og frie fagskolers administration og brug af tilsyn følger gældende regler.
Styrelsen for Undervisning og Kvalitet fører tilsyn med donationer til frie fagskoler.
Det økonomiske tilsyn med frie fagskoler omfatter tilsyn med skolernes økonomi, drift og anvendelse af tilskud.
Viden om eller kendskab til mulige lovovertrædelser eller bekymrende forhold på en fri fagskole kan anmeldes anonymt via whisteblower-ordningen.